開基は行基菩薩で、天平11年（７３９）に開かれたとされる。大同元年（８０６）頃、国司によって堂搭や坊舎が新築され、金滝山大聖院清水寺と号した。天慶10年（９４７）には、藤原秀郷が平将門を討伐した際、祈誓報恩のため堂塔を再建したが、その後、兵火により焼失している。鎌倉時代に入り、栄朝禅師が寺院跡地の煙滅を嘆き堂塔を再建した。江戸時代の慶安2年（１６４９）、徳川幕府により観音堂領として御朱印地10石を賜り、時の住職・亮圓師によって堂塔が再び建立された。観音堂の十一面千手観音立像（県指定文化財）は下野観音霊場の26番札所になっており、広く信仰され参詣者も多い。